39 | | * !BwaIllumina (''implementation phase'') - pe00-bwa-align-pair1.ftl, pe01-bwa-align-pair2.ftl, pe02-bwa-sampe.ftl, pe03-sam-to-bam.ftl, pe04-sam-sort.ftl |
40 | | * !MarkDuplicates (''implementation phase'') - pe05-mark-duplicates.ftl |
41 | | * PicardQC (''implementation phase'') - pe04b-picardQC.ftl |
| 39 | * !BwaIllumina (''done'') - pe00-bwa-align-pair1.ftl, pe01-bwa-align-pair2.ftl, pe02-bwa-sampe.ftl, pe03-sam-to-bam.ftl, pe04-sam-sort.ftl |
| 40 | * !MarkDuplicates (''done'') - pe05-mark-duplicates.ftl |
| 41 | * PicardQC (''in progress'') - pe04b-picardQC.ftl |